双十一大促|plastech-seq新型转录组表型筛选技术,提供高通量筛选服务

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Plastech-seq是昕瑞再生自主知识产权的新型转录组测序技术,该技术非常适合微量细胞和高通量筛选,采用携带Barcode标签和UMI序列的oligo dT,高效结合mRNA上Poly(A)尾端,进行反转录和标记。Barcoded标签可实现多样本混合构建文库,而每个序列的UMI可以对捕获的mRNA序列进行精确定量,以降低PCR扩增所带来的数据偏差。Plastech-seq技术极大降低了样本要求和测序成本,可广泛应用于细胞诱导与分化、细胞培养方法开发、化学药物筛选肿瘤标记物发现等领域。

 
服务流程

 

01方案设计
 
根据客户实验需求提供专业、个性化实验方案设计,包含特殊细胞的培养、筛选条件的探索及生信分析等,
根据项目需求选择设置合理的阴性与阳性的对照

 

02样品处理
 
加入化合物或者设置不同条件处理完成后,明场初步确认细胞整体状态,收集5000~30000个左右的细胞送检,细胞活性大于80%。
03样品收集
 

贴壁细胞:收集5000-30000/孔的活细胞,PBS(无钙镁离子)清洗2次后,加入不低于35ul裂解液重悬;

悬浮细胞:收集5000个左右的活细胞,建议用PBS(无钙镁离子)清洗3次后,加入不低于35ul裂解液重悬

类器官使用胰酶或recovery solution等方式消化基质胶,后采用悬浮细胞的方式收集样本。

 

04文库构建及上机测序
 
裂解后的细胞进行批量的反转录、合成并扩增全长cDNA,经打断、修复及添加接头后进行文库富集,并在二代测序平台进行测序,推荐每孔样品的测序数量不低于1M Reads。

 

05数据分析
 

下机的数据经质量评估后进行基因组比对分析及基因定量分析。

基础分析

1.表达矩阵

2.样本聚类

3.样本打分排名

4.差异表达基因

5.GO term/KEGG pathway

 

高级分析

     SCENIC

     1. 输出转录因子活性打分

     2. regulon开放矩阵

     WGCNA

     1. 输出基因模块

     2. 模块与样本的相关性

     3. 模块内基因富集分析

 

 

 

 

即日起至2023年12月12日,Plastech-seq 仅需¥11110元/96孔板,单孔低于¥115元。预付 ¥50,000  还有95折优惠。 

 

联系方式

邮箱:
业务经理:hongleili@xremed.com

技术支持:junchi@xremed.com                    

电话:18936040318(微信同号)

网站:www.xremed.com

 

 

 

 

2023年10月31日 00:00
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