双十一大促|plastech-seq新型转录组表型筛选技术,提供高通量筛选服务
首页
ꄲ
新闻资讯
ꄲ
公司新闻
ꄲ
双十一大促|plastech-seq新型转录组表型筛选技术,提供高通量筛选服务
Plastech-seq是昕瑞再生自主知识产权的新型转录组测序技术,该技术非常适合微量细胞和高通量筛选,采用携带Barcode标签和UMI序列的oligo dT,高效结合mRNA上Poly(A)尾端,进行反转录和标记。Barcoded标签可实现多样本混合构建文库,而每个序列的UMI可以对捕获的mRNA序列进行精确定量,以降低PCR扩增所带来的数据偏差。Plastech-seq技术极大降低了样本要求和测序成本,可广泛应用于细胞诱导与分化、细胞培养方法开发、化学药物筛选、肿瘤标记物发现等领域。
根据客户实验需求提供专业、个性化实验方案设计,包含特殊细胞的培养、筛选条件的探索及生信分析等,
加入化合物或者设置不同条件;处理完成后,明场初步确认细胞整体状态,收集5000~30000个左右的细胞送检,细胞活性大于80%。
贴壁细胞:收集5000-30000个/孔的活细胞,PBS(无钙镁离子)清洗2次后,加入不低于35ul裂解液重悬;
悬浮细胞:收集5000个左右的活细胞,建议用PBS(无钙镁离子)清洗3次后,加入不低于35ul裂解液重悬;
类器官:使用胰酶或recovery solution等方式消化基质胶,后采用悬浮细胞的方式收集样本。
裂解后的细胞进行批量的反转录、合成并扩增全长cDNA,经打断、修复及添加接头后进行文库富集,并在二代测序平台进行测序,推荐每孔样品的测序数量不低于1M Reads。
下机的数据经质量评估后进行基因组比对分析及基因定量分析。
基础分析
1.表达矩阵
2.样本聚类
3.样本打分排名
4.差异表达基因
5.GO term/KEGG pathway
高级分析
SCENIC
1. 输出转录因子活性打分
2. regulon开放矩阵
WGCNA
1. 输出基因模块
2. 模块与样本的相关性
3. 模块内基因富集分析
即日起至2023年12月12日,Plastech-seq 仅需¥11110元/96孔板,单孔低于¥115元。预付 ¥50,000 元 还有95折优惠。
邮箱:
业务经理:hongleili@xremed.com
技术支持:junchi@xremed.com
电话:18936040318(微信同号)
网站:www.xremed.com