登上Cell和Lancet子刊!适合批量化的RNA-seq

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只需1000个细胞,低至99元/样本的批量化的RNA-seq(DRUG-seq2)

 

RNA-seqRNA测序)技术已经成为探索疾病机制、开发药物以及个性化治疗的重要工具。然而传统RNA-seq技术对样本数量的要求较高,对于量极少的珍贵临床样本如组织、血液或细胞培养物常常面临样本量不足的困境。DRUG-seq2技术凭借其高灵敏度和低样本量需求,以及易于批量化的优势,为疾病探索提供了强有力的支持。

 

DRUG-seq2的核心优势

  • 极少样本需求:低至单个类器官、微升级血液、3~5组织切片或1000细胞,均可实现批量化测序;稳定检出1+基因表达谱;

  • 无需RNA提取操作:简化了样本处理流程,细胞培养样本免提RNA

  • 易于批量化:单次可做上千样本;

  • 灵活的应用场景:从肿瘤溯源、发现新的生物标记物、药物筛选到个性化治疗,DRUG-seq2都能为您的研究提供解决方案。

 

一起来看看玩转DRUG-seq2的应用案例

1.疾病分析

1a.疾病特征描述:利用Drug-seq2发现疾病/亚健康人群各种组织的分子特征

研究者们通过对中国的新冠病毒感染者进行横断面队列研究,深入探讨了病毒在组织中的持久性及其与长期COVID症状的关系。利用昕瑞再生DRUG-seq2技术对感染者的组织样本的表达谱特征进行了全面而细致的分析。
 

Refs:Zuo, Wenting et al. The Lancet Infectious Diseases, Volume 24, Issue 8, 845 – 855
 
1b.肿瘤溯源利用Drug-seq2实现肿瘤组织溯源及其诊断标志物开发

同种组织器官中提取的肿瘤组织/细胞,其转录谱往往保留其原发灶的特征。临床上已经开始使用一组基因的转录谱进行肿瘤组织溯源。通过Drug-seq2,结合临床数据及肿瘤组织分类等信息进行综合分析,有望发现肿瘤组织溯源的潜在诊断标志物、并用于用药指导、分子机制研究等。

 
1c.疾病诊断:利用Drug-seq2发现药物敏感人群的诊断标志物及其分子机制

通过批量采集患者的组织样本(特定组织石蜡切片、血液等)对这些样本进行Drug-seq2批量测序,根据不同治疗预后进行分群,利用机器学习或人工智能模型对数据进行分析,有望发现预测药物治疗效果的诊断标志物,并用于分析潜在新机制。

 
2.药物开发
2a.新药发现:利用Drug-seq2综合评价候选药物的效果及分子机制

在细胞筛选模型上做药物筛选测试,通过DRUG-seq2技术检测药物处理后的细胞转录谱,可以同时获得药物的潜在机制、分子毒性、药效等诸多前瞻性、预测性数据,从而快速全方位的评价候选药物的效果及分子机制。

 
2b.中药研究:利用Drug-seq2开展中药药效、机制及毒性研究

结合中药单体(组分)库进行Drug-seq2测试,不仅可以生成药物单体(组分)的转录组注释数据库,不仅可以分析其分子机理,还可以发现这些单体(组分)全新的药用价值或提示潜在毒性。

 
2c.药物靶点发现:基于Drug-seq2筛选发现药物潜在靶点

基于Drug-seq2化合物筛选,通过转录组聚类分析,鉴定出诱导化学重编程的关键小分子E-616452,通过靶向CDK8发挥启动重编程的作用。

Refs:Li, Jun et al. Cell Reports, Volume 42, Issue 6, 112566
 
3.细胞培养优化:利用Drug-seq2开发及优化特殊细胞群及类器官的培养液配方

利用Drug-seq2批量化检测细胞转录组的优势,可以极低的代价综合比较不同细胞培养成分(或其组合)的培养效果,以开发更好的培养液用于优化细胞(或类器官等)模型,使细胞培养物更能反映生理或疾病特征。

Refs:Xiang et al., Science, 2019. 364 (6438), 399-402.
 
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关于昕瑞再生

 
南京昕瑞再生医药科技有限公司成立于2019年,依托于北京大学分子医学南京转化研究院的软硬件支持。公司核心团队成员来自北京大学、复旦大学、南京大学等知名高校,基于创始团队20余年在干细胞和再生医学领域以及小分子创新药开发领域的知识和经验,打造了世界领先的细胞表型药筛平台CREDIT (Cell Revitalization Drug Innovation Technology)。该平台整合了细胞疾病模型构建、细胞表型多组学定量评测、人工智能等前沿技术,为以细胞疾病表型逆转、衰老表型逆转为原理的新药开发以及基于干细胞分化或原代细胞培养的再生医疗新方法开发奠定了技术基础。公司自主知识产权的代表性技术DRUG-seq2少量细胞高通量3’转录组测序技术、PHDs-seq 高通量靶向转录组测序技术等已在早期药物发现、细胞毒性测试、培养液开发、靶点研究等领域展现威力,广泛应用于自研及科研服务项目。

 

2024年10月9日 00:00
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