登上Cell和Lancet子刊!适合批量化的RNA-seq
只需1000个细胞,低至99元/样本的批量化的RNA-seq(DRUG-seq2)
RNA-seq(RNA测序)技术已经成为探索疾病机制、开发药物以及个性化治疗的重要工具。然而传统RNA-seq技术对样本数量的要求较高,对于量极少的珍贵临床样本如组织、血液或细胞培养物常常面临样本量不足的困境。DRUG-seq2技术凭借其高灵敏度和低样本量需求,以及易于批量化的优势,为疾病探索提供了强有力的支持。
DRUG-seq2的核心优势
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极少样本需求:低至单个类器官、微升级血液、3~5张组织切片或1000个细胞,均可实现批量化测序;稳定检出1万+基因表达谱;
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无需RNA提取操作:简化了样本处理流程,细胞培养样本免提RNA;
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易于批量化:单次可做上千样本;
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灵活的应用场景:从肿瘤溯源、发现新的生物标记物、药物筛选到个性化治疗,DRUG-seq2都能为您的研究提供解决方案。
一起来看看玩转DRUG-seq2的应用案例
1.疾病分析
1a.疾病特征描述:利用Drug-seq2发现疾病/亚健康人群各种组织的分子特征
同种组织器官中提取的肿瘤组织/细胞,其转录谱往往保留其原发灶的特征。临床上已经开始使用一组基因的转录谱进行肿瘤组织溯源。通过Drug-seq2,结合临床数据及肿瘤组织分类等信息进行综合分析,有望发现肿瘤组织溯源的潜在诊断标志物、并用于用药指导、分子机制研究等。
通过批量采集患者的组织样本(特定组织石蜡切片、血液等)对这些样本进行Drug-seq2批量测序,根据不同治疗预后进行分群,利用机器学习或人工智能模型对数据进行分析,有望发现预测药物治疗效果的诊断标志物,并用于分析潜在新机制。
在细胞筛选模型上做药物筛选测试,通过DRUG-seq2技术检测药物处理后的细胞转录谱,可以同时获得药物的潜在机制、分子毒性、药效等诸多前瞻性、预测性数据,从而快速全方位的评价候选药物的效果及分子机制。
结合中药单体(组分)库进行Drug-seq2测试,不仅可以生成药物单体(组分)的转录组注释数据库,不仅可以分析其分子机理,还可以发现这些单体(组分)全新的药用价值或提示潜在毒性。
基于Drug-seq2化合物筛选,通过转录组聚类分析,鉴定出诱导化学重编程的关键小分子E-616452,通过靶向CDK8发挥启动重编程的作用。
利用Drug-seq2批量化检测细胞转录组的优势,可以极低的代价综合比较不同细胞培养成分(或其组合)的培养效果,以开发更好的培养液用于优化细胞(或类器官等)模型,使细胞培养物更能反映生理或疾病特征。
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