SMART-seq — 适配微量细胞/微组织/类器官的全长转录组测序，批量送样更优惠
流式分选下来的细胞，细胞数量少，怎么测转录组？
类器官构建难度高，还带基质胶，怎么测转录组？
单细胞测序深度不够，低丰度的基因我也想看，怎么测转录组?
解决灵魂三问的技术来啦--SMART-seq：无需提取RNA，百个以上细胞、类器官、胚胎样本都适用。适配DRUG-seq2收样方法，一份样本，两个方法任你选。
SMART-seq技术与主流技术对比的特点
SMART-seq技术通过其核心优势，精准化解了生命科学和医学研究领域的低起始量、高灵敏度、高数据丰富度的痛点，为肿瘤异质性、发育生物学及免疫微环境等精细研究领域提供了突破性解决方案。
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延伸阅读
SMART-seq技术原理
2012年Ramsköld团队开发SMART-seq（Switching Mechanism at 5' End of RNA Transcript），首次实现单细胞水平全长mRNA捕获，其核心突破在于模板转换机制（TSO）与低偏差扩增（LD-PCR），近年，SMART-seq技术陆续更新到了第二代乃至第三代，性能更加强大。
SMART-seq2建库技术流程图[1]
SMART-seq应用场景
案例1：肿瘤异质性研究——脑脊液循环肿瘤细胞靶点挖掘
研究人员建立了一种有效的脑脊液循环肿瘤细胞（CSF-CTCs）收集方法，从5例肺腺癌柔脑膜转移(LUAD-LM)患者和3例对照组中分离出单个脑脊液细胞。利用SMART-seq技术对3792个细胞进行单细胞测序，对脑脊液细胞的基因表达情况进行了全面表征。过滤掉低质量细胞后，聚类分析发现正常淋巴细胞在不同微环境下具有相似的表达谱，正常脑脊液样本未发现B细胞。
脑脊液循环肿瘤细胞(CFS-CTCs)的分离和正常脑脊液细胞的组成[2]
案例2：肿瘤治疗和免疫系统发育——结直肠癌肿瘤微环境
淋巴细胞在肿瘤免疫和免疫治疗中有着核心作用。其中，T细胞的状态转化一直是研究中的难点。2018年张泽民教授在Nature的论文，该研究基于SMART-seq单细胞转录组测序技术,对结直肠癌病人癌组织，癌旁组织以及外周血中鉴定的20类不同类型T细胞进行单细胞水平的追踪，对其组织分布特性、克隆性、迁移性和状态变化特性进行了系统性地定量刻画。该文对结直肠癌T细胞进行单细胞研究，系统性地描述结直肠癌相关T细胞的组织分布特性、克隆性、迁移性和状态转化。利用T细胞受体（TCR）作为标签，研究团队发现肿瘤微环境和TCR共同影响了肿瘤浸润CD8效应记忆T细胞向耗竭性T细胞和效应T细胞的转化。
基于SMART-seq测序和STARTRAC算法对T细胞进行动态描绘[3]
[1] Picelli S, Faridani O R, Björklund Å K, et al. Full-length RNA-seq from single cells using Smart-seq2[J]. Nature protocols, 2014, 9(1): 171.
[2] Ruan H, et al. Circulating tumor cell characterization of lung cancer brain metastases in the cerebrospinal fluid through single-cell transcriptome analysis. Clin Transl Med. 2020.
[3] Zhang L, Yu X, Zheng L, et al. Lineage tracking reveals dynamic relationships of T cells in colorectal cancer[J]. Nature, 2018, 564(7735): 268-272.
关于昕瑞再生
南京昕瑞再生医药科技有限公司成立于2019年，依托于北京大学分子医学南京转化研究院的软硬件支持。公司核心团队成员来自北京大学、复旦大学、南京大学等知名高校，基于创始团队20余年在干细胞和再生医学领域以及小分子创新药开发领域的知识和经验，打造了世界领先的细胞表型药筛平台CREDIT (Cell Revitalization Drug Innovation Technology)。该平台整合了细胞疾病模型构建、细胞表型多组学定量评测、人工智能等前沿技术，为以细胞疾病表型逆转、衰老表型逆转为原理的新药开发以及基于干细胞分化或原代细胞培养的再生医疗新方法开发奠定了技术基础。公司自主知识产权的代表性技术DRUG-seq2少量细胞高通量3’转录组测序技术、PHDs-seq高通量靶向转录组测序技术等已在早期药物发现、细胞毒性测试、培养液开发、靶点研究等领域展现威力，广泛应用于自研及科研服务项目。
