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昕瑞再生·技术服务系列一:DRUG-seq2少量细胞高通量3’转录组测序技术

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DRUG-seq2是我们公司拥有自主知识产权少量细胞高通量3’转录组测序技术,该技术采用独特的分子标签设计实现多样本混合构建文库,并开发独特的裂解液实现细胞样本免提取RNA,UMI的设计确保了RNA的精准定量。                   

 

适用样本类型

 
 
 

细胞(贴壁细胞、流式分选细胞)、类器官、胚胎、血液(需提RNA)、组织样本(需提RNA)、FFPE样本(需提RNA)

 

结果信息

 
 
 
涵盖基因
:1-1.2万之间,测序深度
:1M reads/well
测序数据量:
0.3~0.5G/well
 
(报告模板可点击下方链接查看)
昕瑞再生DRUG-seq2分析报告模板(202401).pdf
 

应用方向

 
 
 

①药物筛选;②细胞培养条件体系开发;③基因功能筛选;④分子标志物鉴定;⑤中药注释;⑥干细胞诱导与分化;⑦类器官数据库构建;           

 

送样方式

 
 
 

1:细胞、类器官、胚胎等样本:根据样本数量,我们邮寄自研的专用裂解液(可售商品,货号:XR2300),您收到裂解液后按照我们提供《昕瑞再生测序样品收样标准-2024》提供的方法处理样本后,-80℃保存样本,干冰邮寄给我们;

2:血液、组织、FFPE样本:提取RNA后,-80℃保存,干冰邮寄给我们。

 

服务周期

 
 
 
收样样本并确定合格后,一般2-3周交付结果。
                                                      
 
 
 

我们还同步发售配套试剂盒(精锐CellSignnature少量细胞高通量3转录组(DRUG-seq2)试剂盒【货号:XR2302】,您也可以在实验室自己完成建库啦,自己建库成本更低哦。

 

Q
 
这个测序深度跟RNA-seq相比太少了,
测序质量能保证吗?
A

我们这个技术是3’端测序,经过我们测0.3~0.5G/well是一个性价比比较高的测序量,如果您对测序深度有要求,我们也可以加,这个有个额外的费用,每加1G,费用增加40元/well

Q
你们这
跟RNA-seq有啥区别?
A

我们技术更适合微量细胞量(10^3~10^5)、批量的大规模看转录组变化情况,适合在大量样本中迅速找到最适/最佳条件的筛选,RNA-seq要求大量核酸用于建库,可以同时测大量样本且成本很低。

 

Q
 

 

 你们
信分析吗?都分析那些内容?
 

 

A

我们这个费用是涵盖基础分析的,包括表达矩阵、样品聚类等,如果您有特殊分析,我们也可以处理。到时候根据您具体分析内容定价。

参考文献

1:Ye C et al. DRUG-seq for miniaturized high-throughput transcriptome profiling in drug discovery. Nat Commun. 2018   

2:Li J, et al. Transcriptome-based chemical screens identify CDK8 as a common barrier in multiple cell reprogramming systems. Cell Rep. 2023

 

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关于昕瑞再生

 

 
 

  南京昕瑞再生医药科技有限公司由北京大学资深教授领衔创立,汇聚了一支在干细胞与再生医学领域深耕20余年的顶尖科研团队。公司致力于打造全球领先的细胞表型药物筛选平台,该平台整合了细胞疾病模型构建与细胞表型多组学定量评测等前沿技术,为药物研发提供了强大的技术支持。

   公司拥有多项自主知识产权的核心技术,其中最具代表性的包括DRUG-seq2少量细胞高通量3’转录组测序技术和PHDs-seq高通量靶向转录组测序技术。这些技术在药物筛选、干细胞定向分化、细胞培养优化、中药研究及靶点研究等多个领域展现出卓越的应用价值,并已广泛应用于公司的自主研发项目及科研服务中,为生命科学研究和医药创新注入了强劲动力。

 

 

2025年7月30日 09:00
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