昕瑞再生·技术服务系列二:PHDs-seq高通量靶向转录组测序技术
PHDs-seq(Probe-Hybridization Drug screening-seq)是昕瑞再生拥有自主知识产权的基于探针杂交方式的靶向测序技术,每个样本可获得20-300个基因表达数据,该技术具备极好的孔间平行性,对标qPCR技术,相关性可达0.94,筛选效率是qPCR法近百倍。
适用样本类型
Ø 细胞(贴壁细胞、流式分选细胞)、类器官、胚胎:无需提RNA
Ø 血液、组织样本、FFPE样本:需提RNA
结果信息
涵盖基因数:一次性多达300个基因;测序深度:10~50X,测序数据量:0.1G/well(报告模板可点击下方链接查看)
应用方向
①药物筛选;②细胞培养条件体系开发;③基因功能筛选;④分子标志物鉴定;⑤干细胞诱导与分化;⑥类器官数据库构建;
送样方式
1:细胞、类器官、胚胎等样本:根据样本数量,我们邮寄自研的专用裂解液(可售商品,货号:XR2300),您收到裂解液后按照我们提供《昕瑞再生测序样品收样标准-2024》提供的方法处理样本后,-80℃保存样本,干冰邮寄给我们;
2:血液、组织、FFPE样本:提取RNA后,-80℃保存。干冰邮寄给我们。
3:该技术需要先进行探针设计与合成,我们提供免费设计服务。
服务周期
完成探针验证后,一般2-3周交付结果。
我们还同步发售配套试剂盒(精准CellSignnature靶向转录组(PHDs-seq)试剂盒【货号:XR2303】,您也可以在实验室自己完成建库啦,自己建库成本更低哦。
你
问
我
答
你们这个跟Drug-seq2有啥区别?
PHDs-seq是高通量靶向转录组测序,单次检查涵盖20-300个基因,建库开始前需要设计探针,灵敏度更高,适合目标基因明确情形。其筛选价格相比Drug-seq2更低。
Drug-seq2是3’端转录组测序,涵盖基因数量1-1.2万个,其无需设计探针。更适合目标基因不明确的情形。
如果需要你们提供探针设计的话,如何提供?
我们提供免费设计服务,每个基因设计3对引物,费用是1500元/基因。您也可以自行设计和合成探针,我们完成后续筛选工作。
你们含生信分析吗?都分析那些内容?
我们这个费用是涵盖基础分析的,包括表达矩阵、样品聚类等,如果您有特殊分析,我们也可以处理。到时候根据您具体分析内容定价。
参考文献
Li J, et al. PHDs-seq: a large-scale phenotypic screening method for drug discovery through parallel multi-readout quantification. Cell Regeneration. 2023
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关于昕瑞再生
南京昕瑞再生医药科技有限公司由北京大学资深教授领衔创立,汇聚了一支在干细胞与再生医学领域深耕20余年的顶尖科研团队。公司致力于打造全球领先的细胞表型药物筛选平台,该平台整合了细胞疾病模型构建与细胞表型多组学定量评测等前沿技术,为药物研发提供了强大的技术支持。
公司拥有多项自主知识产权的核心技术,其中最具代表性的包括DRUG-seq2少量细胞高通量3’转录组测序技术和PHDs-seq高通量靶向转录组测序技术。这些技术在药物筛选、干细胞定向分化、细胞培养优化、中药研究及靶点研究等多个领域展现出卓越的应用价值,并已广泛应用于公司的自主研发项目及科研服务中,为生命科学研究和医药创新注入了强劲动力。