昕瑞再生·技术服务系列三:SMART-seq2超微量全长转录组测序技术
SMART-seq2是一种先进的单细胞级的全长转录组测序技术,广泛应用于生命科学研究的多个前沿领域。该技术基于模板转换机制,能从单细胞水平对mRNA进行高效逆转录,实现全长转录本的精准捕获与扩增,为深入解析细胞的基因表达谱提供了有力工具。在肿瘤研究中,它可识别肿瘤细胞亚群,助力精准治疗方案的制定;在发育生物学领域,有助于追踪细胞分化轨迹,揭示胚胎发育和组织再生的分子机制;对于神经科学,能剖析神经元的多样性,为神经系统疾病研究提供关键信息。此外,在免疫细胞研究、罕见细胞类型分析等方面也发挥着重要作用。
适用样本类型
该技术主要适用于各类来源的单细胞级别的样本,如各种组织来源的单细胞、循环肿瘤细胞、胚胎干细胞、神经干细胞、各种类器官、胚胎等,能满足不同研究场景对单细胞转录组分析的需求。
结果信息
可全面覆盖细胞中的绝大多数基因,有效检测低丰度表达基因。测序深度和数据量可根据样本需求与研究目的灵活调整,为深入研究细胞基因表达谱提供充足数据支持。
应用方向
送样方式
根据样本数量,我们邮寄自研的专用裂解液(可售商品,货号:XR2300),您收到裂解液后按照我们提供《昕瑞再生测序样品收样标准-2024》提供的方法处理样本后,-80℃保存样本,干冰邮寄给我们。
服务周期
收样样本并确定合格后,一般2-3周交付结果。
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SMART-seq2与普通转录组测序相比,优势在哪?
普通转录组测序基于混合细胞群体,会掩盖细胞间的异质性信息。而SMART-seq2专注于单细胞或单细胞级别的研究,能够获取每个细胞的独特转录组信息,精准揭示细胞间的差异,发现稀有的细胞亚群和基因表达模式。
可以。SMART-seq2通过全长转录本捕获和高效扩增技术,对低表达基因具有较高的检测灵敏度。即使是在单细胞中表达量较低的基因,也有很大概率被准确检测到,为深入研究细胞的功能和调控机制提供了可能。
你们提供哪些数据分析服务?
我们提供全面的数据分析服务,涵盖基础分析,基础分析包括数据质量评估、基因表达定量、差异表达基因分析等;如果您有特殊的分析需求,我们也可根据具体情况定制化分析方案,费用根据实际分析内容而定。
参考文献
1.Picelli S, Björklund ÅK, Faridani OR, Sagasser S, Winberg G, Sandberg R. Full-length RNA-seq from single cells using SMART-seq2. Nat Protoc. 2014;9(1):171-181.
2.Ramsköld D, Luo S, Wang Y, Li R, Deng Q, Reinius B, Sandberg R. Full-length mRNA-Seq from single-cell levels of RNA and individual circulating tumor cells. Nat Biotechnol. 2012;30(8):777-782.
若您对SMART-seq2技术感兴趣,或有相关研究需求,欢迎随时与我们联系!
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关于昕瑞再生
南京昕瑞再生医药科技有限公司成立于2019年,依托于北京大学分子医学南京转化研究院的软硬件支持。公司核心团队成员来自北京大学、复旦大学、南京大学等知名高校,基于创始团队20余年在干细胞和再生医学领域以及小分子创新药开发领域的知识和经验,打造了世界领先的细胞表型药筛平台CREDIT (Cell Revitalization Drug Innovation Technology)。该平台整合了细胞疾病模型构建、细胞表型多组学定量评测、人工智能等前沿技术,为以细胞疾病表型逆转、衰老表型逆转为原理的新药开发以及基于干细胞分化或原代细胞培养的再生医疗新方法开发奠定了技术基础。公司自主知识产权的代表性技术Drug-seq2少量细胞高通量3’转录组测序技术、PHDs-seq高通量靶向转录组测序技术等已在早期药物发现、细胞毒性测试、培养液开发、靶点研究等领域展现威力,广泛应用于自研及科研服务项目。